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颜宁的问题是：假设时间来到10年后，你已经成为一名PI（PrincipalInvestigator，即独立带领一个实验室的博导），你拥有所需要的所有资源（优秀的科研团队、充足的经费、完善的实验设备、大把的时间），那你最想探索的科学问题是什么？换一种说法，这一辈子有什么科学问题或者技术难题，你能解答或者突破，就觉得今生无憾了？颜宁认为：也许是因为这个问题太非典型、面试太紧张，近一半的同学诚实地表示现阶段还没想过这种问题、一时半会想不出（非常感谢你们的诚恳，这也是很好的答案）。

80年代中至90年代末主持开展直接法用于蛋白质结构分析的试验，获得国际上同类研究的最佳结果主持建立多维空间中的直接法，使之成为当前国际上最有效的、从头求解非公度调制结构和组合结构的方法，与李方华合作建立一种电子显微学的图像处理新方法。

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